Protein–RNA interactions for Protein: Q8N695

SLC5A8, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A8Q8N695 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A8Q8N695 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A8Q8N695 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A8Q8N695 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A8Q8N695 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A8Q8N695 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A8Q8N695 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A8Q8N695 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A8Q8N695 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A8Q8N695 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A8Q8N695 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A8Q8N695 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms