Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN12Q8IYM2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN12Q8IYM2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms