Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC83Q8IWF9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC83Q8IWF9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC83Q8IWF9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms