Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGA4Q8IV77 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGA4Q8IV77 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGA4Q8IV77 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms