Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
WDR49Q8IV35 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR49Q8IV35 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR49Q8IV35 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR49Q8IV35 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR49Q8IV35 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR49Q8IV35 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR49Q8IV35 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR49Q8IV35 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR49Q8IV35 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR49Q8IV35 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR49Q8IV35 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR49Q8IV35 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR49Q8IV35 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR49Q8IV35 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR49Q8IV35 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR49Q8IV35 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR49Q8IV35 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR49Q8IV35 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR49Q8IV35 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR49Q8IV35 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR49Q8IV35 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR49Q8IV35 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR49Q8IV35 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDR49Q8IV35 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms