Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4I7

LIMS2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS2Q7Z4I7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LIMS2Q7Z4I7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LIMS2Q7Z4I7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIMS2Q7Z4I7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms