Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RPTNQ6XPR3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPTNQ6XPR3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPTNQ6XPR3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms