Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSSK4Q6SA08 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSSK4Q6SA08 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms