Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LETMD1Q6P1Q0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms