Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKR9

FAM104B, Protein FAM104B, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM104BQ5XKR9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM104BQ5XKR9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FAM104BQ5XKR9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM104BQ5XKR9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM104BQ5XKR9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM104BQ5XKR9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM104BQ5XKR9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM104BQ5XKR9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM104BQ5XKR9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM104BQ5XKR9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM104BQ5XKR9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM104BQ5XKR9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM104BQ5XKR9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM104BQ5XKR9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM104BQ5XKR9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM104BQ5XKR9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM104BQ5XKR9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms