Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GARNL3Q5VVW2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GARNL3Q5VVW2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GARNL3Q5VVW2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms