Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDHAF4Q5VUM1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDHAF4Q5VUM1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SDHAF4Q5VUM1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDHAF4Q5VUM1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDHAF4Q5VUM1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDHAF4Q5VUM1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDHAF4Q5VUM1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDHAF4Q5VUM1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDHAF4Q5VUM1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDHAF4Q5VUM1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDHAF4Q5VUM1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDHAF4Q5VUM1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SDHAF4Q5VUM1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SDHAF4Q5VUM1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SDHAF4Q5VUM1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDHAF4Q5VUM1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SDHAF4Q5VUM1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms