Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
EFCAB2Q5VUJ9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC36.32■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
EFCAB2Q5VUJ9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
EFCAB2Q5VUJ9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
EFCAB2Q5VUJ9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
EFCAB2Q5VUJ9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms