Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
RPRD2Q5VT52 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RPRD2Q5VT52 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RPRD2Q5VT52 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
RPRD2Q5VT52 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RPRD2Q5VT52 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RPRD2Q5VT52 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
RPRD2Q5VT52 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
RPRD2Q5VT52 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RPRD2Q5VT52 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RPRD2Q5VT52 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RPRD2Q5VT52 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms