Protein–RNA interactions for Protein: Q4AE62

GTDC1, Glycosyltransferase-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTDC1Q4AE62 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTDC1Q4AE62 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTDC1Q4AE62 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTDC1Q4AE62 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms