Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDRF1Q3B7T1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDRF1Q3B7T1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms