Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LRRFIP1Q32MZ4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LRRFIP1Q32MZ4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 303.8 ms