Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6V1FQ16864 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6V1FQ16864 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6V1FQ16864 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6V1FQ16864 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6V1FQ16864 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6V1FQ16864 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6V1FQ16864 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP6V1FQ16864 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP6V1FQ16864 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP6V1FQ16864 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP6V1FQ16864 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP6V1FQ16864 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP6V1FQ16864 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP6V1FQ16864 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1FQ16864 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1FQ16864 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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