Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIC1Q15915 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZIC1Q15915 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms