Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TWIST1Q15672 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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TWIST1Q15672 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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TWIST1Q15672 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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TWIST1Q15672 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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TWIST1Q15672 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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TWIST1Q15672 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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TWIST1Q15672 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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TWIST1Q15672 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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TWIST1Q15672 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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TWIST1Q15672 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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