Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KARSQ15046 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KARSQ15046 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KARSQ15046 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KARSQ15046 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KARSQ15046 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KARSQ15046 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KARSQ15046 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KARSQ15046 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KARSQ15046 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KARSQ15046 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KARSQ15046 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KARSQ15046 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KARSQ15046 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KARSQ15046 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KARSQ15046 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KARSQ15046 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KARSQ15046 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KARSQ15046 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KARSQ15046 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KARSQ15046 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KARSQ15046 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KARSQ15046 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KARSQ15046 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KARSQ15046 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KARSQ15046 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KARSQ15046 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KARSQ15046 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KARSQ15046 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KARSQ15046 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KARSQ15046 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KARSQ15046 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KARSQ15046 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KARSQ15046 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KARSQ15046 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KARSQ15046 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KARSQ15046 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KARSQ15046 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KARSQ15046 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
KARSQ15046 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KARSQ15046 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KARSQ15046 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KARSQ15046 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KARSQ15046 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KARSQ15046 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KARSQ15046 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KARSQ15046 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KARSQ15046 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KARSQ15046 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KARSQ15046 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KARSQ15046 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KARSQ15046 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KARSQ15046 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KARSQ15046 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KARSQ15046 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KARSQ15046 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KARSQ15046 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KARSQ15046 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KARSQ15046 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KARSQ15046 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KARSQ15046 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KARSQ15046 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KARSQ15046 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KARSQ15046 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KARSQ15046 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KARSQ15046 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KARSQ15046 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KARSQ15046 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KARSQ15046 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KARSQ15046 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KARSQ15046 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KARSQ15046 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KARSQ15046 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KARSQ15046 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KARSQ15046 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KARSQ15046 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KARSQ15046 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KARSQ15046 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KARSQ15046 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KARSQ15046 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KARSQ15046 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KARSQ15046 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KARSQ15046 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KARSQ15046 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KARSQ15046 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KARSQ15046 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KARSQ15046 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KARSQ15046 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KARSQ15046 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KARSQ15046 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KARSQ15046 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KARSQ15046 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KARSQ15046 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KARSQ15046 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KARSQ15046 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KARSQ15046 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KARSQ15046 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KARSQ15046 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KARSQ15046 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KARSQ15046 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
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