Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SQLEQ14534 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SQLEQ14534 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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