Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CUL4AQ13619 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CUL4AQ13619 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CUL4AQ13619 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUL4AQ13619 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
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