Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BFSP2Q13515 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BFSP2Q13515 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BFSP2Q13515 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BFSP2Q13515 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BFSP2Q13515 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BFSP2Q13515 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BFSP2Q13515 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BFSP2Q13515 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BFSP2Q13515 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BFSP2Q13515 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BFSP2Q13515 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BFSP2Q13515 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BFSP2Q13515 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BFSP2Q13515 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BFSP2Q13515 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BFSP2Q13515 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BFSP2Q13515 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BFSP2Q13515 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BFSP2Q13515 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BFSP2Q13515 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BFSP2Q13515 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BFSP2Q13515 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BFSP2Q13515 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BFSP2Q13515 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BFSP2Q13515 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BFSP2Q13515 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BFSP2Q13515 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
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