Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRSF5Q13243 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRSF5Q13243 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRSF5Q13243 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms