Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD2Q13200 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD2Q13200 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD2Q13200 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD2Q13200 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD2Q13200 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD2Q13200 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD2Q13200 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD2Q13200 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD2Q13200 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD2Q13200 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMD2Q13200 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMD2Q13200 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMD2Q13200 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMD2Q13200 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD2Q13200 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD2Q13200 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD2Q13200 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD2Q13200 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD2Q13200 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD2Q13200 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms