Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSTF3Q12996 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CSTF3Q12996 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSTF3Q12996 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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