Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SOX4Q06945 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX4Q06945 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX4Q06945 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms