Protein–RNA interactions for Protein: Q06102

YTH1, mRNA 3'-end-processing protein YTH1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YTH1Q06102 TAH18YPR048W 1872 nt4.96□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 HSP104YLL026W 2727 nt4.95□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 JIP4YDR475C 2631 nt4.95□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 YIR007WYIR007W 2295 nt4.95□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 YDR109CYDR109C 2148 nt4.95□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 RPN11YFR004W 921 nt4.95□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 YGL072CYGL072C 360 nt4.95□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 COX17YLL009C 210 nt4.95□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 GLN1YPR035W 1113 nt4.95□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 MTC5YDR128W 3447 nt4.95□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 CLP1YOR250C 1338 nt4.95□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 SPS22YCL048W 1392 nt4.94□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 CNE1YAL058W 1509 nt4.94□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 RPE1YJL121C 717 nt4.94□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 APN1YKL114C 1104 nt4.94□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 SSP120YLR250W 705 nt4.94□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 ROG3YFR022W 2202 nt4.94□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 MCM3YEL032W 2916 nt4.94□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 GIT1YCR098C 1557 nt4.94□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 APE3YBR286W 1614 nt4.94□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 CDC19YAL038W 1503 nt4.93□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 VPS1YKR001C 2115 nt4.93□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 YDL119CYDL119C 924 nt4.93□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 CMR1YDL156W 1569 nt4.93□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 YHL017WYHL017W 1599 nt4.93□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 SUP19tS(UGA)E 82 nt4.93□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 SUP17tS(UGA)I 82 nt4.93□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 SUP16tS(UGA)P 82 nt4.93□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 ICS3YJL077C 396 nt4.93□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 EFM3YJR129C 1020 nt4.93□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 YLR296WYLR296W 327 nt4.93□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 RPS9AYPL081W 594 nt4.93□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 YBR144CYBR144C 315 nt4.93□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 CST6YIL036W 1764 nt4.93□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 CIT3YPR001W 1461 nt4.93□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 PGK1YCR012W 1251 nt4.92□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 CBP4YGR174C 513 nt4.92□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 ARC19YKL013C 516 nt4.92□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 TIF34YMR146C 1044 nt4.92□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 MRPL24YMR193W 777 nt4.92□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 TFB4YPR056W 1017 nt4.92□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 snR34snR34 203 nt4.92□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 PRP24YMR268C 1335 nt4.92□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 STD1YOR047C 1335 nt4.92□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 SVF1YDR346C 1446 nt4.91□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 MDH3YDL078C 1032 nt4.91□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 YGR176WYGR176W 348 nt4.91□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 RPR2YIR015W 435 nt4.91□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 DBR1YKL149C 1218 nt4.91□□□□□ -1.62
YTH1Q06102 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt4.9□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 VAM7YGL212W 951 nt4.9□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 MAD2YJL030W 591 nt4.9□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 SED5YLR026C 1023 nt4.9□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 YML6YML025C 861 nt4.9□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 MRPL22YNL177C 930 nt4.9□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 YNR048WYNR048W 1182 nt4.9□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 MKK2YPL140C 1521 nt4.9□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 RAD3YER171W 2337 nt4.9□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 ATG23YLR431C 1362 nt4.9□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 CCZ1YBR131W 2115 nt4.9□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 ATO3YDR384C 828 nt4.89□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 NPA3YJR072C 1158 nt4.89□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 YOL079WYOL079W 399 nt4.89□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 SLD7YOR060C 774 nt4.89□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 VMS1YDR049W 1899 nt4.89□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 PYC1YGL062W 3537 nt4.88□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 GPI11YDR302W 660 nt4.88□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 RRP4YHR069C 1080 nt4.88□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 REV7YIL139C 738 nt4.88□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 YLR311CYLR311C 348 nt4.88□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 TAF11YML015C 1041 nt4.88□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 YNR040WYNR040W 771 nt4.88□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 MNN5YJL186W 1761 nt4.88□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 DDC1YPL194W 1839 nt4.88□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 SRP101YDR292C 1866 nt4.88□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 GDA1YEL042W 1557 nt4.87□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 SEC20YDR498C 1152 nt4.87□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 RME1YGR044C 903 nt4.87□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 RRP46YGR095C 672 nt4.87□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 RHO3YIL118W 696 nt4.87□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 SUP2tY(GUA)D 75 nt4.87□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 SUP11tY(GUA)F1 75 nt4.87□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 SUP6tY(GUA)F2 75 nt4.87□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 SUP7tY(GUA)J1 75 nt4.87□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 SUP4tY(GUA)J2 75 nt4.87□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 SUP5tY(GUA)M1 75 nt4.87□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 SUP8tY(GUA)M2 75 nt4.87□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 DJP1YIR004W 1299 nt4.87□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 SUP3tY(GUA)O 75 nt4.87□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 MRP17YKL003C 396 nt4.87□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 SPC24YMR117C 642 nt4.87□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 SEC17YBL050W 879 nt4.87□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt4.87□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 YOL163WYOL163W 510 nt4.87□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 IFA38YBR159W 1044 nt4.87□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 NEM1YHR004C 1341 nt4.87□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 ISR1YPR106W 1332 nt4.87□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 PKC1YBL105C 3456 nt4.87□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 YML082WYML082W 1950 nt4.87□□□□□ -1.63
YTH1Q06102 CHS5YLR330W 2016 nt4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 53.8 ms