Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CALD1Q05682 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CALD1Q05682 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CALD1Q05682 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms