Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUD4Q01804 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUD4Q01804 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUD4Q01804 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms