Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPS35P82673 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRPS35P82673 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPS35P82673 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms