Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAE1P78406 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAE1P78406 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAE1P78406 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAE1P78406 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAE1P78406 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAE1P78406 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAE1P78406 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAE1P78406 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAE1P78406 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAE1P78406 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAE1P78406 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAE1P78406 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAE1P78406 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAE1P78406 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAE1P78406 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAE1P78406 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAE1P78406 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAE1P78406 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAE1P78406 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAE1P78406 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAE1P78406 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAE1P78406 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAE1P78406 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAE1P78406 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAE1P78406 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAE1P78406 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAE1P78406 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAE1P78406 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAE1P78406 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAE1P78406 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAE1P78406 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAE1P78406 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAE1P78406 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAE1P78406 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAE1P78406 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAE1P78406 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAE1P78406 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAE1P78406 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAE1P78406 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAE1P78406 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAE1P78406 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAE1P78406 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAE1P78406 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAE1P78406 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAE1P78406 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAE1P78406 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAE1P78406 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAE1P78406 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAE1P78406 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAE1P78406 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAE1P78406 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAE1P78406 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAE1P78406 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAE1P78406 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAE1P78406 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAE1P78406 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAE1P78406 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAE1P78406 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAE1P78406 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAE1P78406 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAE1P78406 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAE1P78406 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAE1P78406 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAE1P78406 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAE1P78406 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAE1P78406 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAE1P78406 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAE1P78406 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAE1P78406 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAE1P78406 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAE1P78406 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAE1P78406 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAE1P78406 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAE1P78406 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAE1P78406 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAE1P78406 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAE1P78406 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAE1P78406 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAE1P78406 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAE1P78406 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAE1P78406 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAE1P78406 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAE1P78406 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAE1P78406 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAE1P78406 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAE1P78406 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAE1P78406 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAE1P78406 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAE1P78406 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAE1P78406 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAE1P78406 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAE1P78406 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAE1P78406 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAE1P78406 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAE1P78406 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAE1P78406 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAE1P78406 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAE1P78406 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAE1P78406 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms