Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P62891 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P62891 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P62891 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P62891 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P62891 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P62891 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P62891 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL39P62891 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P62891 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P62891 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P62891 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P62891 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P62891 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P62891 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL39P62891 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P62891 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P62891 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P62891 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P62891 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P62891 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P62891 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P62891 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P62891 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P62891 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P62891 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P62891 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P62891 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P62891 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P62891 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P62891 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P62891 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P62891 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P62891 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P62891 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P62891 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P62891 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P62891 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P62891 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P62891 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P62891 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P62891 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P62891 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P62891 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P62891 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P62891 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P62891 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P62891 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P62891 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P62891 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P62891 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P62891 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P62891 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P62891 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P62891 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P62891 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P62891 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P62891 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P62891 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P62891 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P62891 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL39P62891 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P62891 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P62891 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P62891 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P62891 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P62891 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P62891 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P62891 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P62891 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P62891 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P62891 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P62891 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL39P62891 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P62891 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P62891 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P62891 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P62891 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P62891 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P62891 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P62891 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P62891 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P62891 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P62891 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P62891 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P62891 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL39P62891 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P62891 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P62891 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P62891 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P62891 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P62891 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P62891 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P62891 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL39P62891 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL39P62891 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P62891 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P62891 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P62891 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL39P62891 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms