Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VBP1P61758 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VBP1P61758 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VBP1P61758 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VBP1P61758 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VBP1P61758 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VBP1P61758 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VBP1P61758 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VBP1P61758 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VBP1P61758 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VBP1P61758 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VBP1P61758 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VBP1P61758 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VBP1P61758 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VBP1P61758 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VBP1P61758 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VBP1P61758 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VBP1P61758 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VBP1P61758 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VBP1P61758 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VBP1P61758 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VBP1P61758 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VBP1P61758 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VBP1P61758 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VBP1P61758 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VBP1P61758 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VBP1P61758 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VBP1P61758 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VBP1P61758 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VBP1P61758 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VBP1P61758 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VBP1P61758 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VBP1P61758 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VBP1P61758 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VBP1P61758 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VBP1P61758 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VBP1P61758 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VBP1P61758 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VBP1P61758 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VBP1P61758 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VBP1P61758 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VBP1P61758 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VBP1P61758 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VBP1P61758 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VBP1P61758 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VBP1P61758 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VBP1P61758 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VBP1P61758 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VBP1P61758 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VBP1P61758 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VBP1P61758 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VBP1P61758 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VBP1P61758 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VBP1P61758 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VBP1P61758 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VBP1P61758 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VBP1P61758 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VBP1P61758 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VBP1P61758 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VBP1P61758 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VBP1P61758 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VBP1P61758 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VBP1P61758 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VBP1P61758 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VBP1P61758 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VBP1P61758 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VBP1P61758 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VBP1P61758 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VBP1P61758 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VBP1P61758 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VBP1P61758 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VBP1P61758 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VBP1P61758 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VBP1P61758 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VBP1P61758 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VBP1P61758 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VBP1P61758 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VBP1P61758 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VBP1P61758 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VBP1P61758 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VBP1P61758 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VBP1P61758 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VBP1P61758 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VBP1P61758 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VBP1P61758 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VBP1P61758 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VBP1P61758 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VBP1P61758 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VBP1P61758 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VBP1P61758 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VBP1P61758 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VBP1P61758 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VBP1P61758 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VBP1P61758 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VBP1P61758 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VBP1P61758 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VBP1P61758 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VBP1P61758 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VBP1P61758 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VBP1P61758 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms