Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB38P57729 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB38P57729 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB38P57729 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB38P57729 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAB38P57729 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB38P57729 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB38P57729 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB38P57729 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB38P57729 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB38P57729 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB38P57729 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB38P57729 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB38P57729 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB38P57729 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB38P57729 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB38P57729 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB38P57729 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB38P57729 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB38P57729 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB38P57729 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB38P57729 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB38P57729 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB38P57729 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB38P57729 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB38P57729 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB38P57729 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB38P57729 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB38P57729 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB38P57729 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB38P57729 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB38P57729 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB38P57729 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB38P57729 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB38P57729 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB38P57729 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB38P57729 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB38P57729 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB38P57729 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB38P57729 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB38P57729 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB38P57729 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB38P57729 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB38P57729 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB38P57729 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB38P57729 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB38P57729 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB38P57729 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB38P57729 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB38P57729 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB38P57729 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB38P57729 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB38P57729 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB38P57729 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB38P57729 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB38P57729 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB38P57729 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB38P57729 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB38P57729 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB38P57729 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB38P57729 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB38P57729 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB38P57729 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB38P57729 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB38P57729 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB38P57729 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB38P57729 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB38P57729 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB38P57729 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB38P57729 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB38P57729 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB38P57729 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB38P57729 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB38P57729 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB38P57729 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB38P57729 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB38P57729 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB38P57729 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB38P57729 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB38P57729 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB38P57729 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB38P57729 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB38P57729 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB38P57729 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB38P57729 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB38P57729 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB38P57729 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB38P57729 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB38P57729 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB38P57729 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB38P57729 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB38P57729 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB38P57729 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB38P57729 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB38P57729 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB38P57729 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB38P57729 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB38P57729 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB38P57729 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB38P57729 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms