Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAG2P55895 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAG2P55895 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAG2P55895 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAG2P55895 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAG2P55895 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAG2P55895 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAG2P55895 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAG2P55895 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAG2P55895 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAG2P55895 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAG2P55895 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAG2P55895 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAG2P55895 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAG2P55895 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAG2P55895 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAG2P55895 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAG2P55895 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAG2P55895 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAG2P55895 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAG2P55895 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAG2P55895 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAG2P55895 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAG2P55895 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAG2P55895 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAG2P55895 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAG2P55895 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAG2P55895 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAG2P55895 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAG2P55895 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAG2P55895 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAG2P55895 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAG2P55895 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAG2P55895 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAG2P55895 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAG2P55895 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAG2P55895 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAG2P55895 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAG2P55895 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAG2P55895 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAG2P55895 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAG2P55895 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAG2P55895 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAG2P55895 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAG2P55895 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAG2P55895 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAG2P55895 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAG2P55895 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAG2P55895 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAG2P55895 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAG2P55895 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAG2P55895 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RAG2P55895 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAG2P55895 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAG2P55895 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAG2P55895 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAG2P55895 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAG2P55895 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAG2P55895 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAG2P55895 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAG2P55895 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAG2P55895 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAG2P55895 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAG2P55895 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAG2P55895 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAG2P55895 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAG2P55895 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RAG2P55895 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAG2P55895 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAG2P55895 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAG2P55895 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAG2P55895 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAG2P55895 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAG2P55895 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAG2P55895 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAG2P55895 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RAG2P55895 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAG2P55895 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAG2P55895 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAG2P55895 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAG2P55895 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAG2P55895 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAG2P55895 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAG2P55895 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAG2P55895 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAG2P55895 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAG2P55895 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAG2P55895 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAG2P55895 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RAG2P55895 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAG2P55895 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAG2P55895 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAG2P55895 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAG2P55895 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAG2P55895 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAG2P55895 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAG2P55895 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAG2P55895 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAG2P55895 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAG2P55895 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms