Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CASP7P55210 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CASP7P55210 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CASP7P55210 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CASP7P55210 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CASP7P55210 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CASP7P55210 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CASP7P55210 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CASP7P55210 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CASP7P55210 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CASP7P55210 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CASP7P55210 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CASP7P55210 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CASP7P55210 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CASP7P55210 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CASP7P55210 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CASP7P55210 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CASP7P55210 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CASP7P55210 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CASP7P55210 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CASP7P55210 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CASP7P55210 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CASP7P55210 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CASP7P55210 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CASP7P55210 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CASP7P55210 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CASP7P55210 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CASP7P55210 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CASP7P55210 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CASP7P55210 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CASP7P55210 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CASP7P55210 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CASP7P55210 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CASP7P55210 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CASP7P55210 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CASP7P55210 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CASP7P55210 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CASP7P55210 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CASP7P55210 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CASP7P55210 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CASP7P55210 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CASP7P55210 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CASP7P55210 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CASP7P55210 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CASP7P55210 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CASP7P55210 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CASP7P55210 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CASP7P55210 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CASP7P55210 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CASP7P55210 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CASP7P55210 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CASP7P55210 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CASP7P55210 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CASP7P55210 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CASP7P55210 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CASP7P55210 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CASP7P55210 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CASP7P55210 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CASP7P55210 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CASP7P55210 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CASP7P55210 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CASP7P55210 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CASP7P55210 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CASP7P55210 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CASP7P55210 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CASP7P55210 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CASP7P55210 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CASP7P55210 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CASP7P55210 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CASP7P55210 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CASP7P55210 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CASP7P55210 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CASP7P55210 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CASP7P55210 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CASP7P55210 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CASP7P55210 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CASP7P55210 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CASP7P55210 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CASP7P55210 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CASP7P55210 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CASP7P55210 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CASP7P55210 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CASP7P55210 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CASP7P55210 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CASP7P55210 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CASP7P55210 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CASP7P55210 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CASP7P55210 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CASP7P55210 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CASP7P55210 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CASP7P55210 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CASP7P55210 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CASP7P55210 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CASP7P55210 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CASP7P55210 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CASP7P55210 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CASP7P55210 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CASP7P55210 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CASP7P55210 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CASP7P55210 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms