Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AQP4P55087 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AQP4P55087 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AQP4P55087 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AQP4P55087 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AQP4P55087 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AQP4P55087 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AQP4P55087 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AQP4P55087 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AQP4P55087 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AQP4P55087 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AQP4P55087 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AQP4P55087 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AQP4P55087 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AQP4P55087 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AQP4P55087 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AQP4P55087 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AQP4P55087 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AQP4P55087 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AQP4P55087 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AQP4P55087 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AQP4P55087 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AQP4P55087 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AQP4P55087 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AQP4P55087 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AQP4P55087 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AQP4P55087 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AQP4P55087 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AQP4P55087 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AQP4P55087 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AQP4P55087 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AQP4P55087 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AQP4P55087 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AQP4P55087 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AQP4P55087 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AQP4P55087 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AQP4P55087 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AQP4P55087 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AQP4P55087 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AQP4P55087 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AQP4P55087 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AQP4P55087 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AQP4P55087 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AQP4P55087 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AQP4P55087 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AQP4P55087 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AQP4P55087 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AQP4P55087 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AQP4P55087 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AQP4P55087 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AQP4P55087 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AQP4P55087 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AQP4P55087 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AQP4P55087 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AQP4P55087 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AQP4P55087 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AQP4P55087 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AQP4P55087 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AQP4P55087 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AQP4P55087 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AQP4P55087 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AQP4P55087 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AQP4P55087 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AQP4P55087 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AQP4P55087 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AQP4P55087 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AQP4P55087 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AQP4P55087 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AQP4P55087 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AQP4P55087 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AQP4P55087 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AQP4P55087 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AQP4P55087 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AQP4P55087 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AQP4P55087 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AQP4P55087 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AQP4P55087 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AQP4P55087 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AQP4P55087 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AQP4P55087 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AQP4P55087 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AQP4P55087 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AQP4P55087 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AQP4P55087 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AQP4P55087 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AQP4P55087 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AQP4P55087 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AQP4P55087 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AQP4P55087 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AQP4P55087 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AQP4P55087 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AQP4P55087 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AQP4P55087 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AQP4P55087 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AQP4P55087 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AQP4P55087 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AQP4P55087 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AQP4P55087 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AQP4P55087 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AQP4P55087 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1028.7 ms