Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGGT1BP53609 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGGT1BP53609 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGGT1BP53609 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
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