Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACLYP53396 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACLYP53396 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ACLYP53396 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACLYP53396 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACLYP53396 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACLYP53396 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ACLYP53396 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACLYP53396 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACLYP53396 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACLYP53396 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACLYP53396 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACLYP53396 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACLYP53396 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACLYP53396 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACLYP53396 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACLYP53396 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACLYP53396 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACLYP53396 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACLYP53396 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACLYP53396 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACLYP53396 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACLYP53396 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACLYP53396 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ACLYP53396 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACLYP53396 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACLYP53396 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACLYP53396 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACLYP53396 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACLYP53396 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACLYP53396 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACLYP53396 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACLYP53396 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACLYP53396 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACLYP53396 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACLYP53396 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACLYP53396 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACLYP53396 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACLYP53396 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACLYP53396 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACLYP53396 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ACLYP53396 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACLYP53396 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACLYP53396 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACLYP53396 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACLYP53396 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ACLYP53396 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACLYP53396 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACLYP53396 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACLYP53396 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACLYP53396 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACLYP53396 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACLYP53396 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ACLYP53396 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACLYP53396 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACLYP53396 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACLYP53396 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACLYP53396 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACLYP53396 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACLYP53396 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACLYP53396 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACLYP53396 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACLYP53396 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACLYP53396 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACLYP53396 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACLYP53396 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACLYP53396 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACLYP53396 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACLYP53396 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACLYP53396 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACLYP53396 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ACLYP53396 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACLYP53396 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACLYP53396 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACLYP53396 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ACLYP53396 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACLYP53396 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACLYP53396 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ACLYP53396 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACLYP53396 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACLYP53396 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACLYP53396 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACLYP53396 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ACLYP53396 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACLYP53396 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACLYP53396 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACLYP53396 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACLYP53396 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACLYP53396 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ACLYP53396 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACLYP53396 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACLYP53396 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACLYP53396 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACLYP53396 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACLYP53396 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACLYP53396 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACLYP53396 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ACLYP53396 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACLYP53396 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACLYP53396 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms