Protein–RNA interactions for Protein: P49281

SLC11A2, Natural resistance-associated macrophage protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A2P49281 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC11A2P49281 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC11A2P49281 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC11A2P49281 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC11A2P49281 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC11A2P49281 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC11A2P49281 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC11A2P49281 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC11A2P49281 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC11A2P49281 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC11A2P49281 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC11A2P49281 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC11A2P49281 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC11A2P49281 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC11A2P49281 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC11A2P49281 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC11A2P49281 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC11A2P49281 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC11A2P49281 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC11A2P49281 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC11A2P49281 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC11A2P49281 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC11A2P49281 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC11A2P49281 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC11A2P49281 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms