Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A3P48751 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A3P48751 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A3P48751 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A3P48751 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A3P48751 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A3P48751 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A3P48751 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A3P48751 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A3P48751 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A3P48751 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A3P48751 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A3P48751 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A3P48751 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC4A3P48751 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC4A3P48751 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC4A3P48751 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A3P48751 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A3P48751 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms