Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNT3P45378 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNT3P45378 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNT3P45378 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms