Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSOP43234 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSOP43234 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSOP43234 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSOP43234 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSOP43234 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSOP43234 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSOP43234 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSOP43234 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSOP43234 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSOP43234 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSOP43234 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSOP43234 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSOP43234 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSOP43234 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSOP43234 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSOP43234 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSOP43234 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSOP43234 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSOP43234 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSOP43234 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSOP43234 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSOP43234 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSOP43234 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSOP43234 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTSOP43234 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSOP43234 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSOP43234 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSOP43234 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSOP43234 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSOP43234 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSOP43234 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSOP43234 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSOP43234 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSOP43234 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSOP43234 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSOP43234 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSOP43234 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSOP43234 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSOP43234 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSOP43234 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSOP43234 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSOP43234 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSOP43234 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSOP43234 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSOP43234 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSOP43234 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSOP43234 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSOP43234 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSOP43234 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSOP43234 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSOP43234 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSOP43234 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSOP43234 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSOP43234 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSOP43234 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSOP43234 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSOP43234 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSOP43234 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSOP43234 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CTSOP43234 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSOP43234 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSOP43234 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSOP43234 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSOP43234 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSOP43234 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSOP43234 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSOP43234 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTSOP43234 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTSOP43234 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CTSOP43234 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CTSOP43234 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSOP43234 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTSOP43234 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSOP43234 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSOP43234 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSOP43234 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSOP43234 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSOP43234 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSOP43234 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSOP43234 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSOP43234 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSOP43234 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSOP43234 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSOP43234 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSOP43234 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSOP43234 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSOP43234 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSOP43234 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSOP43234 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSOP43234 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSOP43234 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSOP43234 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSOP43234 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSOP43234 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSOP43234 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSOP43234 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSOP43234 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSOP43234 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSOP43234 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.2 ms