Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERPINF1P36955 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPINF1P36955 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms