Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC5P28715 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERCC5P28715 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ERCC5P28715 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC5P28715 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms