Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN8P19075 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TSPAN8P19075 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms