Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGA1P17096 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HMGA1P17096 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGA1P17096 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms