Protein–RNA interactions for Protein: P17035

ZNF28, Zinc finger protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28P17035 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF28P17035 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF28P17035 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF28P17035 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms